山东省中医药文化博物馆的发展历程始于2011年，3月17日，中医药博物馆筹建领导小组成立，正式启动博物馆的筹备工作，为后续建设奠定了组织基础。

2012年是博物馆建设的关键推进年，3月5日，牟平区发展和改革局对学校中医药博物馆项目立项进行批复，同意该建设项目，标志着博物馆建设正式获得官方认可；10月21日，烟台市城市规划局同意学校博物馆建设设计方案，为项目的后续施工明确了规划方向。

2013年9月27日，中医药博物馆布展工作领导小组成立，重点推进博物馆布展相关筹备工作，推动项目从建设阶段向内容完善阶段过渡。

2014年，博物馆建设进入全面实施阶段。5月，博物馆完成土建工程，为后续布展和功能完善提供了硬件保障；6月20日，学校印发《山东中医药高等专科学校中医药博物馆征集中医药史校史文物及实物暂行办法》《山东中医药高等专科学校中医药博物馆接受捐赠管理暂行办法》《山东中医药高等专科学校中医药博物馆接受捐赠财产的使用管理办法》三项制度，规范了文物征集、捐赠及管理工作；10月，博物馆职能部门正式成立，宋永刚任馆长，标志着博物馆的运营管理体系初步建立。

2015年，博物馆逐步完善人员配置与前期筹备工作。3月，徐宏举、刘岩、舒冠凤借调至博物馆，充实了工作人员队伍；9月4日，吕慧媛入职博物馆；10月8日，孙亚楠入职博物馆，进一步加强了团队力量；10月20日，博物馆开展设计招标工作，最终上海美术中标，确定了博物馆的设计方案，为布展施工做好了准备。

2016年，博物馆布展工作正式启动。3月4日，博物馆布展项目施工招标顺利完成，北京清尚中标；4月，北京清尚正式入驻博物馆，布展工作全面展开，博物馆的整体面貌逐步清晰。

2017年是博物馆发展史上具有里程碑意义的一年，实现了从建设到运营的跨越。4月11日，徐宏举正式调入博物馆，进一步稳定了工作人员队伍；4月18日，学校召开中医药文化宣传月启动暨中医药博物馆开馆工作部署会议，明确了开馆相关事宜；5月18日，博物馆正式开馆，向公众开放，开启了中医药文化传播的新篇章；5月23日，博物馆挂牌“烟台市老龄委活动基地”，拓展了服务功能；6月16日，博物馆正式更名为“山东省中医药文化博物馆”，提升了博物馆的定位与影响力；8月16日，博物馆被遴选为“烟台市首批市级中小学生研学旅行基地”，助力青少年中医药文化教育；9月8日，陈凯、王思雪入职博物馆，为团队注入新的活力；11月27日，博物馆荣获“山东省中医药文化宣传教育基地”称号，得到了省级层面的认可。

2018年，博物馆在荣誉建设和功能拓展上取得显著成效。1月12日，荣获“山东省首批中医药健康旅游示范基地创建单位”；1月22日，被山东省总工会等八个部门联合授予“山东省创新型班组”，同时荣获“山东省工人先锋号”荣誉称号，彰显了团队工作成效；4月16日，挂牌“山东省中小学生研学实践教育活动行走齐鲁资源单位”，进一步扩大了研学教育覆盖面；4月28日，荣获“全省高校思想政治工作十大建设计划创新重点项目”校园文化品牌项目，凸显了其在校园文化建设中的重要作用；6月6日，被国家中医药管理局确定为“全国中医药文化宣传教育基地”，跻身全国中医药文化宣传教育的重要阵地；12月26日，挂牌为山东潍坊一气周流小儿推拿学术联盟“一气周流小儿推拿学术联盟中医药文化研学基地”，丰富了研学合作形式。

2019年，博物馆持续深化发展，荣誉与合作成果丰硕。4月12日，与鲁东大学签约挂牌为“国际学生中医药文化体验基地”，推动中医药文化走向国际；6月27日，被山东省科学技术协会命名为2019年度山东省科普教育基地；7月17日，《讲好中医故事，打造杏林宣教品牌》项目荣获教育部第五届全国高校“礼敬中华优秀传统文化”特色展示项目，提升了文化传播影响力；8月2日，被烟台市科学技术协会命名为2019年度烟台市科普教育基地；8月23日，荣获牟平区文化和旅游局组织的“2019牟平旅游名片——牟平最佳研学行”称号，得到地方旅游部门的认可。

2020年，博物馆在巩固现有成果的基础上，不断拓展新的发展领域。4月15日，被山东省文化和旅游厅与山东省卫生健康委员会确定为首批“山东省中医药健康旅游示范基地”，正式成为省级中医药健康旅游示范载体；5月25日，学校杏林种子行动项目荣获“烟台市学雷锋志愿服务最佳志愿服务项目”，彰显了博物馆的社会服务价值；8月，通过2020年度山东省科普教育基地复验，确保了科普教育工作的持续规范开展；11月，当选中国民族医药协会中医药（民族医药）博物馆联盟理事单位，同时被中共烟台市委宣传部命名为“烟台市爱国主义教育基地”，进一步提升了行业影响力和社会认可度；12月，荣获2020年度全国科普日烟台主场活动优秀组织单位，体现了其在科普工作中的组织能力。

2021年，博物馆在课程建设、基地认证和人员补充上取得多项突破。3月24日，《探秘岐黄宝藏传承大医精诚精神》研学旅行课程荣获“烟台市第二批市级优秀研学旅行课程”；5月24日，被中共烟台市委宣传部和烟台市社会科学联合会授予“2021年度烟台市社会科学普及教育基地”；8月11日，被省教育厅、省发改委、省文化和旅游厅评为第三批省级中小学生研学基地，同时《探秘岐黄宝藏传承大医精诚精神》研学旅行课程荣获“第三批省级优秀研学课程”；8月23日，被山东省归国华侨联合会确认为第二批山东省华侨国际文化交流基地，助力华侨文化交流；9月，李亚楠入职博物馆，进一步充实了工作人员队伍；11月15日，通过山东省文化和旅游厅国有博物馆设立备案，规范了博物馆的运营管理；12月16日，被烟台市疾病预防控制中心确认为烟台市健康教育基地；12月20日，被山东省疾病预防控制中心确认为山东省健康教育基地；12月27日，中医健康讲座及义诊活动和公益讲解活动荣获山东省2021年全国科普日优秀活动，彰显了科普工作的实效。

2022年，博物馆持续推进各项工作，实现新的发展。4月2日，被中国科学技术协会命名为2021-2025年第一批全国科普教育基地，跻身全国科普教育优秀阵地；4月23日，被中共烟台市委纪委、烟台市监察委员会命名为烟台市“治未病”廉政教育基地，拓展了廉政教育服务功能；4月，武永刚接任馆长，带领博物馆继续发展；10月7日，被中共烟台市牟平区委宣传部命名为第二批牟平区新时代文明实践示范基地；11月10日，博物馆杏林种子志愿服务队入选全国大学生科技志愿服务示范团队；12月28日，主办的2022年全国科普日牟平区主场活动暨相关健康义诊活动被山东省科学技术协会评为山东省2022年全国科普日活动优秀活动；12月29日，被烟台市科学技术协会评为烟台市2022年全国科普日活动优秀组织单位。

2023年，博物馆在基地建设、团队发展和赛事参与上成果显著。4月，被命名为烟台市少先队校外实践教育基地，同时被山东省免疫学会命名为免疫与健康科普基地；7月，被中共烟台市委市直机关工作委员会命名为市直机关党员集中教育培训现场教学点（市直机关主题党日活动阵地）；8月，被命名为烟台市党校系统现场教学基地；10月20日，博物馆杏林青春宣教团入选2023年全国大学生口腔健康志愿宣讲团；11月27日，博物馆书法国画协会入选2023年“中国历代绘画大系”全国大学生志愿宣讲团；11月29日，被中共烟台市委办公室、烟台市人民政府办公室命名为第一批全市民族团结进步教育基地；11月，荣获2023第四届山东省研学旅游创新线路设计大赛（院校组）优秀奖；同年，徐宏举荣获山东省中医药文化科普巡讲专家，吕慧媛当选烟台市科普专家、山东省科学技术协会第十次代表大会代表、牟平区科协委员，并荣获第三届烟台市科普讲解大赛二等奖。

2024年，博物馆持续深耕中医药文化传播与服务，收获多项荣誉。1月11日，荣获烟台市2023年全国科普日活动优秀组织单位、2023年全国科普日优秀活动；2月2日，博物馆杏林青春宣教团入选全国大学生中医药志愿宣讲团；2月5日，该宣教团入选2024年全国大学生科技志愿服务团队；4月，被牟平区统战部命名为牟平区党外知识分子共识教育基地；5月，“悠悠岐黄——中医药发展历史展”荣获全市博物馆陈列展览精品推介精品奖；11月，吕慧媛和刘琦等凭借《山野草变“救命药”——传统医药献给世界的礼物青蒿素》荣获粤港澳大湾区中医药（民族医药）文化科普讲解大赛一等奖，李亚楠、黄晓璨、徐宏举等凭借《医风道骨》荣获该赛事三等奖，彰显了博物馆团队的专业素养和宣讲能力。